O objetivo dessa revisão foi comparar o hipoclorito de sódio e a clorexidina como soluções irrigantes utilizadas no tratamento de canais radiculares. Uma solução irrigadora ideal deve apresentar ação antimicrobiana, dissolver resíduos teciduais, promover molhamento com finalidade de facilitar a instrumentação, e apresentar biocompatibilidade com os tecidos adjacentes. O hipoclorito de sódio utilizado em diferentes concentrações para limpeza de canais radiculares tem sido a solução de escolha entre os profissionais por apresentar ação antimicrobiana e atuar como solvente tecidual. Porém, atualmente, a clorexidina vem sendo muito utilizada como solução irrigadora devido a propriedades específicas que viabilizam sua utilização, tais como substantividade, efetividade antimicrobiana, e baixa toxicidade. Este estudo caracterizou-se por ser uma pesquisa bibliográfica realizada nas seguintes bases de dados eletrônicos: Plataforma CAPES, PubMed, SCIELO, Google acadêmico, Oasis e LILACS, com a busca de publicações científicas relevantes entre os anos de 2016 e 2021 relacionados ao tema. Os termos utilizados para seleção dos artigos foram: Clorexidina. Hipoclorito de sódio. Irrigantes do canal radicular. Os operadores booleanos OR e AND foram utilizados junto aos descritores para refinar a busca Após a filtragem inicial, os artigos que apresentavam como temática principal AVALIAÇÃO DOS IRRIGANTES CLOREXIDINA E HIPOCLORITO NA DESCONTAMINAÇÃO DO SISTEMA DE CANAIS RADICULARES foram avaliados e classificados em elegíveis (estudos que apresentaram relevância e tinham possibilidade de ser incluídos na revisão) e não elegíveis (estudos sem relevância, sem possibilidade de inclusão na revisão). De um universo de 129 publicações consideradas elegíveis, 10 publicações representam estudos que descrevem um comparativo entre as soluções irrigadoras Clorexidina e hipoclorito de sódio. Conclui-se que o Hipolorito de Sódio é a solução mais indicada e mais utilizada como irrigante principal; O Hipoclorito possui amplo espectro de ação e efeito de dissolução tecidual; A clorexidina deve ser utilizada preferencialmente em casos de pacientes alérgicos ao Hipoclorito de Sódio;